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同研究所では定点医療機関からの報告数をもとに、定点以外を含む全国の医療機関を1週間に受診した患者数を約153万人と推計し、第28週以降これまでの累積の推計患者数は738万人(95%信頼区間：722.57万人～753.43万人)としている。

また、都道府県別では愛知県(53.19)、秋田県(50.64)、滋賀県(50.06)、福岡県(48.73)、宮城県(46.24)、大分県(45.78)、香川県(42.11)、新潟県(40.52)、石川県(40.10)、青森県(38.92)の順となっている。定点当たり報告数は、前週と同様全ての都道府県で10.00を上回り、前週よりも多い25道県で30.00を上回ったが、首都圏、愛知県、大阪府、兵庫県等の大都市圏の多くでは報告数の減少がみられている。ただし、第45週は祝日によって診療日数が前週よりも少ない医療機関が多く、報告数もその影響を受けている可能性があるため、今後の推移を慎重に観察していく必要があるとしている。

警報レベルを超えている保健所地域は300箇所(45都道府県)とさらに増加し、注意報レベルのみを超えている保健所地域は207箇所(45都道府県)となった。

同研究所では、最近の発生患者の殆どが新型インフルエンザに罹患しているものと推定している。

・第45週の受診患者数(推定)：約153万人(先週比1万人減)

・各都道府県のインフルエンザ警戒レベルの状況
　※≪　≫は注意報・警報、（　）は死者についての情報

北海道：≪警報・注意報≫(2人：基礎疾患等あり)
青森県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
岩手県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等なし)
宮城県：≪警報・注意報≫(2人：基礎疾患等あり)
秋田県：≪警報(県内全域)≫
山形県：≪警報・注意報≫
福島県：≪警報・注意報≫
茨城県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
栃木県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等なし)
群馬県：≪警報・注意報≫
埼玉県：≪警報・注意報≫(3人：基礎疾患等あり1人、基礎疾患等なし2人)
千葉県：≪警報・注意報≫
東京都：≪警報・注意報≫(5人：基礎疾患等なし3人、基礎疾患等あり2人)
神奈川県：≪警報・注意報≫(5人：基礎疾患等あり3人、基礎疾患等なし2人)
新潟県：≪警報・注意報≫
富山県：≪警報・注意報≫
石川県：≪警報・注意報≫
福井県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
山梨県：≪警報・注意報≫
長野県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
岐阜県：≪警報・注意報≫
静岡県：≪警報・注意報≫
愛知県：≪警報・注意報≫(5人：基礎疾患等あり4人、基礎疾患等なし1人)
三重県：≪警報・注意報≫
滋賀県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
京都府：≪警報・注意報≫(2人：基礎疾患等あり)
大阪府：≪警報・注意報≫(6人：基礎疾患等あり4人、基礎疾患等なし2人）
兵庫県：≪警報・注意報≫(7人：基礎疾患等あり5人、基礎疾患等なし2人)
奈良県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
和歌山県：≪警報・注意報≫
鳥取県：≪注意報のみ≫
島根県：≪警報・注意報≫
岡山県：≪警報・注意報≫
広島県：≪警報・注意報≫
山口県：≪警報・注意報≫
徳島県：≪注意報のみ≫
香川県：≪警報・注意報≫
愛媛県：≪警報・注意報のみ≫
高知県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
福岡県：≪警報・注意報≫(2人：基礎疾患等あり1人、基礎疾患等なし1人)
佐賀県：≪警報(県内全域)≫
長崎県：≪警報・注意報≫
熊本県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等の有無不明)
大分県：≪警報・注意報≫
宮崎県：≪警報・注意報≫
鹿児島県：≪警報・注意報≫(1人：基礎疾患等あり)
沖縄県：≪警報・注意報≫(2人：基礎疾患等あり1人、基礎疾患等なし1人)
合計： 死者52人

(死者データ：11月13日現在レスキューナウまとめ)